Biologická filtrační média jsou základem stabilního akvária, protože poskytují velkou plochu pro užitečné bakterie, které zpracovávají odpadní látky a pomáhají udržovat dobrou kvalitu vody. V mořské akvaristice se používají zejména v sumpech, externích filtrech nebo v reaktorech, kde podporují dlouhodobou rovnováhu systému. Při výběru se vyplatí zaměřit zejména na typ a poréznost média, doporučený objem podle objemu a způsob umístění, aby jím procházel rovnoměrný průtok vody. Důležité je i šetrné čištění, abyste nezničili kolonii bakterií a biologická filtrace fungovala stabilně.